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转录因子相关数据库.docx
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转录因子相关数据库
在分子生物学和生物信息学领域,转录因子(Transcription
Factor,TF)是研究基因表达和调控的重要工具。转录因子是一种蛋
白质,它可以结合到 DNA 序列上,调控特定基因的转录和表达。为了
方便研究者们更深入地了解转录因子的功能和作用,多个转录因子相
关数据库已陆续建立。
一、 TRANSFAC:综合转录因子数据库
TRANSFAC 是德国生物信息学研究所开发的一个综合性的转录因子数
据库,收录了来自不同物种的大量转录因子和其相应的 DNA 结合位点。
这个数据库致力于提供全面的转录因子数据,包括来自文献报道和新
预测的结合模式,并可以通过检索、下载或编程访问这些数据。
二、 JASPAR:动植物转录因子数据库
JASPAR 是一个动植物转录因子数据库,它包含了大量的来自不同生
物物种的转录因子序列及其相应的 DNA 结合位点。JASPAR 的注释信
息丰富,包括来自实验验证的转录因子结合位点数据、预测的结合位
点模型以及转录因子家族的进化关系等。
三、 TRANSTER:转录因子交互作用数据库
TRANSTER 是一个转录因子间交互作用的数据库。它通过收集和整合
来自各种来源的数据,包括基因芯片、质谱和 RNA 测序等,来发现和
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zhuzhi
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