# 3D Medical Segmentation GAN
### 3D Liver Segmentation with GAN
#### This project created under `Koç University Summer Research Program`
## Architecture:
<img src="Assets/Model.png" width="600">
`Input Shape: n x 128 x 128 x 128`<br/>
`Output Shape: n x 128 x 128 x 128`
In this project we purpose to segmentation medical scans without unsuccessful loss functions in segmentation area like `Mean Squared Error` (not useful for segmentation) or `Dice Coefficient` (using for area comparison but not useful for gradient descent optimization function) and for benefit the best use of `GAN` algorithmic logic.
### ! Project and Documentations are under construction!
#### Currently Used Dataset: [DEU Liver Segmentation Dataset](https://eee.deu.edu.tr/moodle/mod/page/view.php?id=7872)
# For Users
### Segmentation Scans:
`python3 predict.py <Scan_files_path>`
# For Developers
### Processing Dataset:
`python3 get_dataset.py`
### Model Training:
`python3 train.py`
# Important Notes
- Used Python 3.6.0 with Anaconda
- Install necessary modules with `sudo pip3 install -r requirements.txt` command.
- Load CUDNN(used `cudnn/7.0.5/cuda-9.0` for this project) module before training.
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3D肝脏分割_使用GAN实现3D肝脏Liver分割算法_附项目源码_优质项目实战.zip (10个子文件)
3D肝脏分割_使用GAN实现3D肝脏Liver分割算法_附项目源码_优质项目实战
predict.py 2KB
Assets
Model.png 432KB
Colab ipynb
3D_Med_Seg.ipynb 3KB
HPC Cluster Job
job.sh 1KB
u-net-architecture.png 101KB
get_models.py 9KB
requirements.txt 78B
get_dataset.py 7KB
train.py 7KB
README.md 1KB
共 10 条
- 1
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