1.推荐配置环境:
(1)ubuntu22.0
(2)python3.10,涉及的库:math,sys(一般为内置库,无需另外安装)。
注意本脚本中所有python调用名均为python3,使用时根据自身情况替换。
(3)Gaussian16, 确保环境变量中的调用名为g16
2.使用方法:
(1)采用以下gaussian输入文件模板计算得到 log 输出文件,注意替换文件名、计算内存、计算CPU核心数。(2)将g16_output_file.gjf 文件、run.sh、co-revDSD.sh、def2-G3.py、enthalpy.py放在一个文件夹内,shell窗口下cd至co-revDSD_script文件夹,首先添加执行权限,输入chmod +x ./run.sh,然后输入run.sh g16_output_file(注意将g16_output_file文件名替换为自己的,不带后缀名)。
###gaussian输入文件模板####
%chk=g16_output_file.chk
%mem=50GB
%nproc=36
# B3LYP/6-31G(d) opt
Title Card Required
0 3
O -1.57823130 0.71428570 0.00000000
O -2.73983130 0.71428570 0.00000000
--Link1--
%chk=g16_output_file.chk
# Geom=AllCheck Guess=Read B3LYP/6-31G(d) Freq
--Link1--
%chk=g16_output_file.chk
# Geom=AllCheck Guess=Read DSDPBEP86/def2SVP IOp(3/125=0079905785,3/78=0429604296,3/76=0310006900,3/74=1004) em=gd3bj IOp(3/174=0437700,3/175=-1,3/176=0,3/177=-1,3/178=5500000)
--Link1--
%chk=g16_output_file.chk
# Geom=AllCheck Guess=Read DSDPBEP86/def2TZVPP IOp(3/125=0079905785,3/78=0429604296,3/76=0310006900,3/74=1004) em=gd3bj IOp(3/174=0437700,3/175=-1,3/176=0,3/177=-1,3/178=5500000)
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基于co-revDSD方法的计算程序
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2024-05-13
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def2-G3.py 347B
co-revDSD.sh 5KB
使用说明.txt 2KB
run.sh 103B
enthalpy.py 1KB
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