SpatialPatterningOfImmuneCells

免疫细胞的空间格局 该存储库包含示例代码，随附于计算拓扑论文[INSERT LINK]，其中我们使用拓扑技术分析了肿瘤中免疫细胞的空间格局。 从组织学图像到拓扑观察的完整分析流程可分为四个主要步骤： 组织学扫描到细胞点云 多参数持久性计算 多参数景观计算 统计分析与分类 在该存储库中，我们提供了示例笔记本，详细介绍了该管道的新颖部分：第3步和第4步。可使用HTML版本的笔记本以方便​​访问。 下面概述了执行分析的所有四个步骤的脚本和软件。 组织学图像到细胞点云 多参数持久性计算 多参数横向计算在笔记本Example Writing RIVET Input, Computing Multiparameter Persistence and Landscapes.ipynb详细说明Example Writing RIVET Input, Computing Multiparamet