Chimericognizer:Chimericognizer是一种新颖且精确的基于光学图的嵌合重叠群校正工具

Chimericognizer软件 描述 Chimericognizer是一种新颖且准确的嵌合重叠群校正工具，可以相互校正嵌合重叠群和嵌合光学图分子。 在Chimericognizer中，该问题被建模为加权顶点覆盖问题，用于确定冲突时是否要校正重叠群或光学图分子。 实验表明，我们的工具可以用更少的时间胜过有经验的基因组装配问题研究人员所做的手动工作。 Chimericognizer用python编写。 到目前为止，Chimericognizer只能在Unix / Linux系统上运行。 依赖度 Python Chimericognizer的主要部分是用Python编写的，因此必须安装Python。 建议使用Python2.7（或更高版本）。 Perl在Chimericognizer中，我们使用脚手架工具Irys-scaffolding的一个perl脚本“ fa2cmap_multi.pl