hardyweinberg:与 Schraiber 等人 (2012)，遗传学相关的代码

哈德温伯格 这组 R 函数将通过拟合杂合子数量的精确分布，在小样本量中执行近亲繁殖系数的最大似然估计。 此外，它还可以对单个个体的近亲繁殖系数进行复合似然估计。 使用脚本 安装 调用source("HWtest.r")加载脚本。 唯一需要的包是EMT 。 数据输入格式 数据需要采用与 VCF 文件类似但不完全相同的格式。 所需的列是：1）染色体，2）位置，3）杂合子数，4）等位基因频率，5-末端）每个杂合子个体为1，每个纯合个体为0（参考或替代）。 例如，以下数据对应于 Complete Genomics 数据集中的 9 个 YRI 个体： V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 1 564654 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 564936 0 2 0 0 0 0