bpipe：Bpipe-用于运行和管理生物信息学管道的工具

欢迎来到布珀 Bpipe提供了一个平台，用于运行大型生物信息学工作，该工作平台由一系列处理阶段（称为“管道”）组成。 2021年1月-新！ 发布了！ 下载 （Google论坛） Bpipe已发表在！ 如果您使用Bpipe，请引用： Sadedin S，Pope B和Oshlack A，Bpipe：用于运行和管理生物信息学管道的工具，生物信息学 为什么是布珀？ 许多使用生物信息学数据的人最终都将工作作为外壳程序脚本运行。 尽管这使它们易于运行，但有很多限制。 例如，脚本中途失败时，通常很难说出它们在哪里或为什么失败，甚至从失败的角度重新启动作业也更加困难。 没有自动记录已执行的命令或自动捕获控制台输出，以确保以后可以查看发生了什么。 有时作业会失败一半，留下一半创建的文件，这些文件可能会与好的文件混淆。 修改管道也很耗时且容易出错-添加或删除阶段会在多个位置进行修改，这意味着更改