纳米FG
NanoFG集成了现有的基因组工具和附加代码,以提供易于使用的管道,用于从Nanopore测序数据中检测融合基因
安装
git clone https://github.com/SdeBlank/NanoFG.git NanoFG
cd NanoFG
virtualenv venv -p python3
. venv/bin/activate
pip install -r requirements.txt
将path.ini文件中的所有路径调整为已安装的工具
怎么跑
bash NanoFG.sh -f </ path> [-n SAMPLE_NAME] [-s选择] [-cf] [-cc] [-df] [-dc]
OR
bash NanoFG.sh -b </ path> [-v </ path>] [
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