petcmodel:衣藻光合电子传递链模型

光合电子传递链模型 模型 我们共享 Python 文件，该文件再现了 Ebenhoeh 等人发表的论文中描述的数学模型。 2014 年，最初在 MATLAB 中开发该模型包括一组七个耦合常微分方程，并捕获了模式生物藻类莱茵衣藻的主要蛋白质复合物和光合光React关键产物的时间演变。 这些方程在 petcModel.py 中实现，它们的来源在出版物的电子补充材料中有详细解释。 lightProtocol.py：包括几个模拟所需的光照函数 parametersPETC.py：存储所有参数 misc.py：包含两种额外的方法来计算腔内 pH 值 模拟.py：包括积分方法和计算稳态的方法，也基于绝对误差容限 petcResults：帮助复制出版物中包含的一些数字的附加文件 出版物 Ebenhoeh, O., Fucile, G., Finazzi, G., Rochaix, JD & Golds