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VerciniAnalysisJ:通过纳米结构固定(VerCINI)显微镜数据对垂直成像进行ImageJ分析
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2021-03-29
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韦尔西尼分析 信息这是一组用于分析VerCINI(通过纳米结构固定化进行垂直细胞成像)数据的ImageJ脚本,该数据最初发布在Whitley等人的bioRxiv 2020中。此软件按原样提供,不提供保修。 概述 安装 要安装ImageJ Ring分析插件: 通过其更新站点安装ActionBar插件。 如果尚未安装StackReg和TurboReg,请通过其更新站点安装它们: : 从更新站点安装FeatureJ 从此处安装PureDenoise 下载当前的VerciniAnalysisJ软件并解压缩。 将目录“ VerciniAnalysisJ-XXX”复制到斐济脚本/ Plugins /文件夹文件夹中,并重命名为“ VerciniAnalysisJ”。 打开斐济,通过运行插件> VerciniAnalysisJ>启动Vercini ActionBar启动插件。 使用
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VerciniAnalysisJ-master.zip (18个子文件)
VerciniAnalysisJ-master
.gitignore 114B
Start_ROI_manager.ijm 23B
Batch_denoise_register.py 3KB
Batch_kymotrace_statistics.ijm 5KB
Ridge_Filter.ijm 326B
LICENSE 34KB
testing
Indiv_rings
test_denoise_reg_ring2.tif 128KB
test_denoise_reg_ring1.tif 128KB
test_denoise_reg_ring3.tif 128KB
Draw_60x60_ROI.ijm 28B
Batch_crop.py 3KB
README.md 2KB
Batch_denoise_register_crop.py 4KB
Remove_last_row.ijm 88B
Batch_denoise.py 3KB
Start_Vercini_ActionBar.ijm 1KB
.gitattributes 66B
Save_ROI_.py 575B
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Airva128
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