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APS-NGS-day1-PM
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2021-02-12
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高级数据分析-NGS数据分析简介谢菲尔德大学动植物科学系 对齐Illumina RNA-seq数据 尼古拉·纳多Alison Wright 本实用程序的目的是学习如何将Illumina RNA-seq数据与参考基因组进行比对并组装转录本。 我们将使用Heliconius melpomene的多个个体的表达数据的数据集。 目录 准备参考基因组 对齐RNA-seq读数以供参考 可视化路线 评估贴图质量 汇总成绩单 实用-初始设置 首先,必须在ShARC中使用交互式会话来运行本教程。 您还将向Job提交作业。 为此,您应该使用ssh登录到ShARC,然后请求与qrsh进行交互式会话。 您的shell提示符应显示sharc-nodeXXX (XXX是介于001和172之间的数字),而不是@sharc-login1或@sharc-login2 。 对于此特定教程,我们align在/ fastda
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陶涵煦
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