vartovcf：将VarDictVarDictJava的变体转换为VCF v4.2格式

伐他夫 将VarDict / VarDictJava的变体转换为VCF v4.2格式。 ❯ VarDictJava/build/install/VarDict/bin/VarDict \ -b input.bam \ -G /references/hg38.fa \ -N dna00001 \ -c1 -S2 -E3 -g4 -f0.05 \ --fisher \ calling-intervals.bed \ | vartovcf -r /references/hg38.fa -s dna00001 \ | bcftools sort -Oz > variants.vcf.gz 产品特点 与VarDict捆绑在一起的Perl脚本不同，此工具逐记录流式传输 仅支持以仅肿瘤模式生成的变体记录的转换 输出VCF记录未bcftools s