nagl:将图卷积网络应用于分子的游乐场

纳格兰 一种将图卷积网络应用于分子的游乐场，重点是学习连续的“原子型”嵌入以及从这些经典的分子力场参数中学习。 该框架主要基于Wang，Fass和Chodera撰写预印本。 安装 可以使用conda安装此框架所需的依赖项： conda env create --name nagl --file devtools/conda-envs/test_env.yaml python setup.py develop 注意：目前需要商业上的OpenEye oechem和oequacpac软件包作为依赖项。 剧本 scripts/data-set-generation/openff/run.py一个脚本，将从其SMILES表示中加载一组分子，计算其AM1部分电荷和Wiberg键序（WBO），然后对它们进行腌制以进行功能化。 scripts/training/run.py一个脚本，加载一个训练序列和