PERCEPTRON:用于自上而下的蛋白质组学的GPU加速的蛋白形式识别流水线

PERCEPTRON是可免费使用的基于Web的蛋白质组学识别管道，用于自上而下的蛋白质组学（TDP）。自上而下的蛋白质组学是一种新兴的实验方案，用于分析完整的蛋白形式。 PERCEPTRON搜索管道汇集了以下算法：（i）完整质量调谐，（ii）从头肽序列标签提取，（iii）电子光谱比较，（iv）鉴定翻译后修饰以及截短的蛋白质，以及（ v）用于候选蛋白质评分的新型复合评分方案。 PERCEPTRON通过利用NVIDIA GPU技术以及Microsoft ASP.NET和ANGULAR框架来实现高性能。获得的搜索结果包括蛋白质列表，它们的分数和有关匹配信息的详细信息。此信息可以可视化并下载。总体而言，PERCEPTRON旨在利用最先进的算法，填补用于TDP数据的开源和开放式结构蛋白质识别软件的关键空白。