SCTLD-STT:重新编写代码的代码，“使用基于快速场的测序方法在珊瑚和上层水域中鉴定出富含石质珊瑚组织病的细菌”
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2021-05-10
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SCTLD-STT-main.zip （38个子文件） 
SCTLD-STT-main 
ASV_STT2020_filt_decontam.txt 490KB
DADA2_st.thomas.Rmd 25KB DNAextraction_contaminants_decontam.txt 2KB Code_to_Reproduce_Figures_in_Manuscript.Rmd 67KB metadata_STT2020_no_chloromito.txt 17KB ASVsequences_STT2020.txt 2.41MB Code_to_Reproduce_Figures_in_Manuscript.md 67KB metadata_STT2020_filt_decontam.txt 17KB metadata_STT2020.txt 14KB ASV_STT2020.txt 4.42MB taxonomy_STT2020_nospecies.txt 1.27MB ASV_STT2020_no_chloromito.txt 1.78MB Appendix_1_DNAextraction_contaminants_decontam.txt 2KB taxonomy_STT2020_nospecies_no_chloromito.txt 817KB README.md 3KB Figures 
fig-unnamed-chunk-2-2.png 111KB fig-Manuscript analysis PCoA Coral-1.png 134KB fig-unnamed-chunk-2-1.png 181KB fig-Bubble plot of disease-associated ASVs in coral tissue samples-1.png 431KB fig-Figure S6-1.png 418KB fig-Dispersion Analysis-1.png 130KB fig-Figure 1-1.png 156KB fig-Figure S8-1.png 363KB fig-Figure S7-1.png 111KB fig-Figure 1-2.png 143KB fig-Bubble plot of potential pathogens in the coral seawater-1.png 363KB fig-unnamed-chunk-1-1.png 257KB fig-Final Filtering-3.png 119KB fig-Final Filtering-2.png 229KB fig-Manuscript Analysis PCoA All-1.png 142KB fig-PCoA of only healthy corals-1.png 117KB fig-Final Filtering-1.png 110KB fig-Figure S5-1.png 256KB fig-Manuscript analysis PCoA Seawater-1.png 129KB taxonomy_STT2020_nospecies_filt_decontam.txt 221KB Appendix_2_SyringeMethod_contaminants_decontam.txt 117KB
Code_to_Reproduce_Figures_in_Manuscript.html 5.86MB SyringeMethod_contaminants_decontam.txt 117KB资源评论
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