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SWAPHI: Smith-Waterman on Intel Xeon Phi:在共享主机Xeon Phis上进行的第一个蛋白...
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2021-04-30
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第一个并行算法可在共享主机的多个Intel Xeon Phi协处理器上加速Smith-Waterman蛋白质数据库的搜索。 通过在UniProtKB / TrEMBL数据库中进行搜索,SWAPHI在单个至强融核上的性能高达每秒588亿个单元更新(GCUPS),而在四个至强非织造布上的性能高达228.4 GCUPS。
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swaphi-v1.0.5.tar.gz (27个子文件)
swaphi-v1.0.5
Makefile 954B
src
Utils.cpp 1KB
AlignCoreInter.h 6KB
BuildIndex.cpp 15KB
KeyValueSort.h 6KB
Align.h 3KB
Matrix.cpp 16KB
AlignCore.cpp 1KB
SeqFileParser.h 2KB
Align.cpp 21KB
Sequence.cpp 2KB
SeqFileParser.cpp 6KB
Matrix.h 408B
MyFile.h 993B
QueryProfile.h 3KB
Sequence.h 471B
Utils.h 495B
BuildIndex.h 998B
main.cpp 924B
AlignCoreIntra.cpp 9KB
AlignCoreIntra.h 1KB
AlignCore.h 1KB
Macros.h 2KB
AlignCoreInter.cpp 22KB
.project 812B
.cproject 8KB
README 96B
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可爱的小树懒
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