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java笔试题算法-Complete-Striped-Smith-Waterman-Library:Complete-Strip...
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java笔试题算法SSW 图书馆 用于基因组应用的 SIMD Smith-Waterman C/C++/Python/Java/R 库 许可证:麻省理工学院 版权所有 (c) 2012-2015 波士顿学院 特此授予任何人免费获得本软件副本和相关文档文件(“软件”)的许可,不受限制地处理本软件,包括但不限于使用、复制、修改、合并的权利、发布、分发、再许可和/或出售软件的副本,并允许向其提供软件的人员这样做,但须符合以下条件: 上述版权声明和本许可声明应包含在软件的所有副本或重要部分中。 本软件按“原样”提供,不提供任何形式的明示或暗示的保证,包括但不限于适销性、特定用途的适用性和不侵权的保证。 在任何情况下,作者或版权持有人均不对任何索赔、损害或其他责任承担任何责任,无论是在合同诉讼、侵权行为或其他方面,由软件或软件的使用或使用或其他原因引起的或与之相关的软件。 作者: C实现:赵梦瑶 C++ 包装器:Wan-Ping Lee Python包装器:赵永安 Java 包装器:Daniel Cameron R包:南霄 接触: 赵梦瑶 李万平 赵永安 丹尼尔·卡梅伦 南霄 上次修订:2020
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Complete-Striped-Smith-Waterman-Library-master.zip (43个子文件)
Complete-Striped-Smith-Waterman-Library-master
README.md 14KB
src
main.c 17KB
ssw_cpp.cpp 13KB
ssw
Aligner.java 9KB
Example.java 1KB
Alignment.java 2KB
ssw.h 8KB
ssw.c 31KB
pyssw.py 14KB
ssw_cpp.h 9KB
example.c 5KB
kseq.h 8KB
example.cpp 2KB
sswjni.c 2KB
Makefile 1KB
ssw_lib.pyc 7KB
ssw_lib.py 12KB
demo
test.seq 103B
query.fastq 297B
r1.fa 439B
target1.fa 42B
output.sam 0B
Virus_genome.fa.gz 822B
target.fa 14B
1M.fa 977KB
ref.fa 10.6MB
1k.fa 1021B
target.fastq 285B
old.txt 16KB
query2.fa 85B
query.fa 12B
10M.fa 9.54MB
100k_illumina1.fastq.gz 5.8MB
10k.fa 10KB
54mer_hap1_1.100.fastq 14KB
54mer_hap1_1.100.fa 9KB
new.txt 16KB
100k.fa 98KB
pRef.fa 50B
pRead.fa 48B
query1.fa 41B
target2.fa 92B
r1_query.fq 355B
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