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spatial-selection
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2021-04-19
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事实证明,在计算群集上安装spammr软件包的所有已编译依赖项都非常麻烦(我尝试了CPH服务器和MPI EVA服务器)。 同时,在我从事这一工作的同时,我向程序包添加了新功能,该功能允许拆分模型生成代码( 01_define_model.R )和SLiM脚本生成代码( 02_neutral_scripts.R , 04_selection_scripts.R )-两者可以在安装了spammr的任何计算机上运行-从实际运行这些模拟( 03_run_neutral.sh , 05_run_selection.sh )开始。 最后一部分仅需要有效的SLiM安装,即使没有垃圾邮件发送者,也可以在任何群集上完成。 理想情况下,可以从一个R脚本运行所有内容,但是我想在某些情况下,用户希望一次只执行一个步骤(例如,在我们的情况下,需要在不同的计算机上运行不同的阶段)。 我绝对会改变这一点,因为我觉
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spatial-selection-main.zip (12个子文件)
spatial-selection-main
europe
splits.tsv 52B
1.png 6KB
maps.tsv 30B
gen_time.txt 3B
script.slim 19KB
names.txt 4B
populations.rds 13KB
04_selection_scripts.R 965B
01_define_model.R 758B
02_neutral_scripts.R 1KB
README.md 1KB
00_setup.R 146B
共 12 条
- 1
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WiwiChow
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