神经元5
一个基于HDF5的库,用于存储大型图形并对其进行并行操作。
介绍
神经图库实现了基于HDF5的格式,用于存储大型神经网络的连接信息,执行并行图分区和分析。
Neurograph假设将神经元网络模型中神经元之间的突触连通性表示为存储为邻接表的有向图,其中顶点表示网络中的神经元,并由称为唯一全局标识符(gid)的无符号整数进行标识。
基本概念和术语
用顶点和有向边来描述神经元之间的连通性,其中每个顶点都有一个与之关联的整数id,它对应于网络仿真中各个神经元的id。 每个边缘由源顶点和目标顶点以及许多其他属性(例如距离和突触权重)标识。 此外,顶点是在神经元群体中组织的,其中每个群体都由属于同一生物学类型的神经元(例如颗粒细胞或篮状细胞)的一组神经元组成。 连通性按投影进行组织,其中投影是两个种群之间或同一种群之间的一组连接。 投影通过其源和目标人口以及这两个人口之间的所有边来标识
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