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GCC / BOSC 2018培训 该存储库包含有关的的教程材料。 简而言之Nextflow 用于数据分析管道的工作流引擎,其字符串集中在: 可移植性 重现性 可扩展性 易用性 如何? 功能/React式编程模型 解耦和任务隔离 简洁的DSL,可重复执行任务 务实,允许快速原型制作和迭代 隐藏复杂性 与错误共存(!) 先决条件 类似于Unix的操作系统(Linux,macOS等) Java 8或更高版本 Docker引擎1.10.x(或更高版本) 奇点2.3.x(或更高版本,可选) 正确配置了AWS Batch计算环境(可选) (可选) 安装 使用以下命令安装Nextflow: curl -fsSL https://get.nextflow.io | bash 上面的代码片段在当前目录中创建了nextflow启动器。 完成安装,将其移动到PATH环境变量中的目录中,例如
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gccbosc18-training-master.zip (21个子文件)
gccbosc18-training-master
.gitignore 23B
env.yml 181B
nextflow.config 41B
script2.nf 951B
data
ggal
lung_2.fq 676KB
liver_2.fq 676KB
gut_2.fq 676KB
gut_1.fq 676KB
transcriptome.fa 170KB
lung_1.fq 676KB
liver_1.fq 676KB
script1.nf 215B
LICENSE 1KB
script4.nf 1KB
script6.nf 2KB
script7.nf 2KB
README.md 20KB
script5.nf 2KB
script3.nf 539B
img
banner.png 239KB
nf-hack18.png 3.61MB
共 21 条
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