ClinicalTransformerNER:由UF HOBI NLP实验室开发的具有SOTA算法的命名实体识别库

临床变压器NER 目标 该软件包是基于变压器的NER系统的实现，用于临床信息提取任务。 我们旨在为研究人员提供一种简单快捷的工具，以在无需全面了解变压器的情况下进行临床NER。 我们还实施了一种策略，以处理长度大于常规转换器限制（512个令牌）的序列，而不会截断任何令牌。 当前可用的型号 BERT（基本，大型，经过mimiciii预训练的） RoBERTa（基础，大型，经过mimiciii预训练的） ALBERT（基本，大，xlarge，xxlarge，mimiciii预训练） ELECTRA（基础，大型，模仿模拟培训） DistilBERT（基础） XLNet（基础，大型，mimiciii预培训） Longformer（allenai / longformer-base-4096，allenai / longformer-large-4096） DeBERTa（Micros