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mykrobe:数分钟内抗生素耐药性预测
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Mykrobe 文献资料 请参阅以获得文档。 快速开始 安装: bioconda conda install -c bioconda mykrobe 从源pip3 install . && mykrobe panels update_metadata && mykrobe panels update_species all pip3 install . && mykrobe panels update_metadata && mykrobe panels update_species all 或使用奇异性或docker(有关详细信息,请参见Wiki) 在Mtb上运行,生成结果的JSON文件: mykrobe predict my_sample_name tb \ --output out.json \ --format json \ --seq reads.fq.
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mykrobe:数分钟内抗生素耐药性预测 (108个子文件)
Singularity.def 1KB
NC_000962.3.fasta 4.27MB
BX571856.1.fasta 2.81MB
NC_000962.3.gb 2.78MB
.gitignore 1KB
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species1_data.20200801.tar.gz 473B
MANIFEST.in 61B
tox.ini 352B
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distance task.ipynb 7KB
mtbc_hierarchy.json 31KB
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README.md 798B
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variants.py 16KB
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lineages.py 9KB
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species_dir.py 4KB
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test_species_dir.py 4KB
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__init__.py 209B
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mykrobe_atlas_pyinstaller_windows.spec 1KB
mykrobe_atlas_pyinstaller.spec 1002B
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Rainy.凌霄
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