皮肤科医生
Gromologist是一个软件包,旨在简化对GROMACS拓扑文件(.top和.itp)以及兼容结构(.pdb和.gro)的处理,编辑和操作。
安装
可以通过键入pip install gromologist直接通过pip获得最新的“官方”发行版。
要获取最新的开发版本,请先在本地克隆git repo( git clone https://gitlab.com/KomBioMol/gromologist.git ),然后通过输入pip install .将软件包安装到Python中pip install . 在Gromologist主目录中。 如果您使用的是Anaconda,则/path/to/anaconda/bin/pip 。
用法
读写文件
Top和Pdb是库的核心类,应该分别提供拓扑和结构对象的表示形式。 要初始化它们,应将文件的路径传递给构造函数:
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