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otp:一键式管道的只读镜像; 请参阅GitLab的主要回购
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2021-04-16
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一键式管道 一键式管道(OTP)是一种数据管理平台,用于以高通量设置运行生物信息学管道,并组织所得的数据和元数据。 它始于德国癌症研究中心和海德堡大学的内部协作工具,以协调在那里处理的数千个基因组和PB级数据。 由于这两个都是公共资助的机构,因此该代码在的哲学下被开源。 我们,OTP团队,希望它能帮助您管理自己的PB级基因组数据! 为什么选择OTP? 我们开发了OTP,以帮助我们以可扩展的自动化方式管理常规分析。 我们通过数百个项目中的多个管道,以不同的组合和不同的参数处理成千上万的癌症基因组学样本。 比任何人都可以手工管理的更多。 OTP自动化完整的数字过程,从原始序列数据的导入,通过比对和基因组事件的识别到通知项目成员其分析完成。 一旦按照自己的喜好设置了项目配置,只需要“一键式”导入一些FASTQ文件,而OTP则负责其余的工作。 (免责声明:OTP是一种功能强大的工具,但是没
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