充水网络
洪水填充网络(FFN)是一类神经网络,专门用于复杂形状和大型形状的分割,尤其是在脑组织的EM数据集中。
有关更多详细信息,请参见相关出版物:
这不是Google的官方产品。
安装
无需安装。 要安装必要的依赖项,请运行:
pip install -r requirements.txt
该代码已在配备Tesla P100 GPU的Ubuntu 16.04.3 LTS系统上进行了测试。
训练
可以使用train.py脚本训练FFN网络,该脚本需要一个TFRecord坐标文件,在该文件中可以从输入量中采样数据。
准备训练数据
有两个脚本可为存储在HDF5文件中的带标签数据集生成训练坐标文件: compute_partitions.py和build_coordinates.py 。
compute_partitions.py变换标签卷成中间体积,其中每个体素的值A对应于相同标
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