anndata:R中带注释的多元观测数据

anndata-带注释的数据 是常用的Python软件包，用于跟踪数据和学习的注释，并且可用于读取和写入h5ad文件格式。 它也是scanpy python软件包（Wolf，Angerer和Theis 2018）中使用的主要数据格式。 但是，在R中使用scanpy / anndata可能会很麻烦。 当尝试读取h5ad文件时，R用户可以采用以下两种方法之一来解决此问题。 A）您可以手动读取文件（因为它是H5文件），但这需要大量的手动工作，并且需要对h5ad和H5文件格式的工作方式有很多了解（并且，还要期待因隐藏的hdf5r错误而引起的严重头痛） 。 或B）通过网状结构与scanpy和andata进行交互，但遇到了将某些python对象转换为R的问题。 我们最近在CRAN上发布了 ，它是Python程序包的R包装器-顶部撒有一些语法，使R用户感到宾至如归。 将R anndata仍在于积极