没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
sra_metadata_toolkit:使使用 SRA 元数据变得简单
共33个文件
png:22个
rb:9个
md:1个
需积分: 10 0 下载量 139 浏览量
2021-06-01
11:04:53
上传
评论
收藏 4.39MB ZIP 举报
温馨提示
SRA 元数据工具包 目前托管在作为测试版。 (有时React很慢,抱歉!) 目录 1 这是什么 2 使用方法 2.1 SRA ID 转换器 2.2 SRA 元数据解析器 2.3 FastQC 结果2.3.1 读取文件 3 发展 3.1 关于本项目 3.2 许可 1 这是什么 SRA Metadata toolkit 是使用 Sequence Read Archive 中存档的 NGSeq 数据元数据的项目和 Web 服务。 它允许命令行访问以获取解析为查询指定的 JSON 格式数据。 它还提供每个序列数据的质量摘要。 详细信息和更新在。 2 使用方法 用户可以通过指定查询来获取部分或全部元数据。 2.1 SRA ID 转换器 将 SRA ID 转换为所属/相关 ID。 JSON 格式输出 /idconvert/<origin>.to_<dest>
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
sra_metadata_toolkit-master.zip (33个子文件)
sra_metadata_toolkit-master
sra_metadata_parser.rb 12KB
handler.rb 2KB
sra_id_converter.rb 6KB
fix_metadata_directory.rb 598B
sync_and_unzip_spec.rb 770B
resources
website
images
ebi_advancedsearch.png 177KB
ddbj_website.png 186KB
drasearch_example02.png 153KB
ebi_download_text.png 250KB
ebi_idsearch_result.png 228KB
dbcls_stat02.png 266KB
ebi_idsearch.png 354KB
dbcls_disease_freq.png 198KB
ebi_pipeline.png 270KB
ncbi_website.png 293KB
dbcls_disease_tree.png 174KB
dbcls_stat01.png 176KB
ncbi_idsearch.png 203KB
ebi_website.png 230KB
find_sraid.png 451KB
dbcls_qc.png 122KB
dbcls_publication.png 252KB
dbcls_website.png 140KB
drasearch.png 204KB
drasearch_example01.png 204KB
ddbj_pipeline.png 230KB
drasearch_result.png 139KB
fastqc_result_parser.rb 6KB
fastqc_utils.rb 6KB
.gitignore 83B
README.md 3KB
ebi_metadata_parser.rb 2KB
sync_and_unzip.rb 2KB
共 33 条
- 1
资源评论
FeMnO
- 粉丝: 20
- 资源: 4608
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功