basenji:深度卷积神经网络的顺序监管活动预测_basenji模型资源-CSDN文库

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basenji:深度卷积神经网络的顺序监管活动预测（246个子文件）

ABOUT_THIS_DATA 115B

ABOUT_THIS_DATA 75B

sequences.bed 229KB

unmap_macro.bed 149KB

hg38_gaps_binsize2048_numconseq10.bed 20KB

contigs.bed 12KB

hg19_gaps.bed 11KB

cage_peaks.bed 241B

gata4.bed 23B

BUILD 576B

data 13B

gata4.fa 128KB

human.hg38.genome 3KB

human.hg19.genome 2KB

human.hg19.genome 2KB

mouse.mm10.genome 1KB

.gitignore 141B

.gitignore 89B

.gitignore 76B

.gitignore 52B

.gitignore 41B

.gitignore 34B

.gitignore 29B

.gitignore 27B

.gitignore 27B

.gitignore 20B

.gitignore 19B

.gitignore 14B

.gitignore 10B

.gitignore 7B

.gitignore 3B

gencode_chr9.gtf 3.22MB

genes.gtf 26KB

rfx6.gtf 23KB

one_record_for_train_and_test.h5 42.69MB

sad.h5 2.43MB

sadr.h5 2.43MB

usad.h5 600KB

model_best.h5 34B

explore_model.ipynb 846KB

basenji_sad_viz.ipynb 572KB

basenji_sat_vcf_viz.ipynb 113KB

train_test.ipynb 56KB

tutorial.ipynb 54KB

test_sad_debug.ipynb 27KB

sad.ipynb 25KB

sat_mut.ipynb 25KB

genes.ipynb 16KB

preprocess.ipynb 11KB

params.json 2KB

params.json 1KB

params_human.json 1KB

params_mouse.json 1KB

params_basset.json 1KB

params_small.json 1KB

statistics.json 221B

params.json 20B

LICENSE 9KB

Makefile 837B

README.md 6KB

README.md 2KB

preprocess.md 2KB

train.md 2KB

variants.md 2KB

regulatory.md 1KB

accuracy.md 1019B

README.md 892B

README.md 652B

README.md 340B

basset_image.png 478KB

bam_cov.py 50KB

seqnn_util.py 40KB

layers.py 40KB

basenji_data2.py 35KB

basenji_test_genes.py 31KB

basenji_data.py 30KB

basenji_data_align.py 30KB

basenji_hdf5_single.py 27KB

blocks.py 24KB

basenji_motifs.py 24KB

basenji_motifs_denovo.py 24KB

trainer.py 23KB

basenji_test_orig.py 22KB

basenji_sat_h5.py 20KB

basenji_hdf5_cluster.py 20KB

basenji_test_h5.py 19KB

vcf.py 19KB

akita_data.py 18KB

basenji_data_gene.py 18KB

basenji_sadf.py 16KB

params.py 16KB

basenji_train_folds.py 15KB

basenji_test_folds.py 15KB

basenji_sed.py 15KB

tfrecord_batcher.py 15KB

sad5.py 14KB

basenji_hdf5_genes.py 14KB

basenji_bench_phylop_folds.py 14KB

basenji_sat_bed.py 13KB

basenji_fetch_app1.py 13KB

共 246 条

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梦小露

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