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TREND:用于蛋白质功能和进化分析的TREND平台
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2021-04-14
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TREND-高度可定制的蛋白质分析计算平台 TREND是一个平台,使研究人员能够探索蛋白质功能,从而鉴定蛋白质特征,基因邻域和操纵子,将邻近基因聚类,并将所有这些数据整合到系统生物学背景中,并与RefSeq,Pfam,CDD和MiST数据库进行交叉引用。 该平台为调整分析的每个步骤提供了充足的机会。 TREND具有可扩展的模块化体系结构,可以轻松添加新功能。 该平台的骨干是用Java编写的,新模块可以用任何语言编写,并且可以集成到平台中,只要它们可以作为受参数控制的命令行应用程序启动即可。 TREND代表N eighborhoods和d omains的TR基于EE-E xploration。 瓦迪姆·古梅罗夫(Vadim M.Gumerov),伊戈尔·B·朱林(Igor B.Zhulin)(2020年)。 TREND:一个基于系统发育,域结构和基因邻域分析探索原核生物蛋白质功能的平台
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