phylospatial:用系统发育树和空间数据做有趣的事情的脚本

pat骨 用系统发育树和空间数据做有趣的事情的脚本 血统分布模型 Python脚本可估计种内谱系的分布，以配合我们在PlosOne中的论文一起使用。该脚本与ArcGIS库（arcpy）一起运行。 警告：本节的作品，但尚不能保证是用户友好的。 欢迎反馈。 R脚本可估计种内谱系的分布。 血统分布模型现在是完全开源的。 系统发育地方病（PE）和系统发育多样性（PD） R脚本以计算系统发育特有性（PE），包括示例脚本和数据 R脚本可直接从一堆物种或血统分布模型中计算PD，PE和其他指标。 保护规划 使用Marxan优化区域选择，以保留系统发育多样性（PD）。 这些脚本获取空间数据和系统发育信息，并格式化Marxan的输入文件。 该版本是beta版（2017年10月20日），欢迎反馈。 新的！ 此代码随附于我们即将在2017年10月25日发布的论文集B中。 丹·罗萨尔（Dan Rosauer）