OTU-Taxonomy-Identification

通过 OTU 共丰度网络对未知 OTU 进行分类识别 库依赖 GSL - GNU 科学图书馆MLPACK - 开源可扩展的 C++ 机器学习库 所有这些都应该在您的发行版包中可用经理。 如果没有，您将不得不手动编译它们中的每一个。 有关更多信息，请参阅每个包的文档。 安装说明 然后你可以通过键入来构建它， 制作 如果遇到问题，请删除任何现有的编译文件， 清洁 在再次运行“make”之前 跑步 在 MRF 目录中， ./ [参数] 参数： --list 包含集群列表的文件，CROP 集群程序的输出 --rdp 每个集群的 RDP 分类文件 --rdpThresh 低于该阈值的集群将被视为未知 --rdpClass 使用 RDP 类级别结果进行分类 --rdpPhylum 使用 RDP 门级别结果进行分类 --posCorr 使用正相关的 OTU --negCorr 使用负相关 OTU