矛：通过仿真评估祖先重建的标准性能

长矛 通过模拟评估祖先重建的标准性能 学分 SPEARS是由Heather Manching在Randall J. Wisser博士的指导下开发和编码的。 这项工作得到了USDA-NIFA农业和食品研究计划资助第2011-67003-30342号和2018-67011-28052的支持。 感谢郑朝智博士在经营兔子方面的支持。 概述 在这里，我们介绍SPEARS，这是基于模拟的祖先单倍型推断性能评估的管道。 SPEARS确定推断的祖先单倍型图的可靠性。 它可以用于评估新方法或工具的性能，以及检查对设想的或现有的人口设计的期望。 模拟用于为许多个体生成全基因组单倍型图。 保留此真实数据，但也可以对其进行修改（在管道中），以模仿稀疏基因型数据，该数据进入插补和单倍型重建的标准多步过程。 将预期数据与推断数据进行比较可以对结果进行基准测试。 我们开发了SPEARS，以便通过SAEGUS模拟，M