没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
OrbiDataPynbAnalysisCode:分析orbitrap数据(无原始文件读取器逻辑)
共34个文件
xlsx:11个
csv:8个
py:5个
需积分: 9 0 下载量 38 浏览量
2021-04-08
04:58:01
上传
评论
收藏 37.91MB ZIP 举报
温馨提示
OrbiDataPynbAnalysisCode 欢迎使用我们的“一个代码来统治所有人”,即Eiler Lab为处理Orbitrap数据所做的集体编码。 该代码的主要功能在“ DataAnalyzerWithPeakInteg.py”中,该功能具有将RAW文件转换为python友好的数据结构并从这些数据结构计算同位素比率的所有处理功能。 这些结果全部输出到输入RAW文件所来自的原始文件夹/文件位置。 您可以使用“ DataAnalyzerWorker.py”处理数据,该示例提供了如何结合实验调用文件夹的示例,以及可以打开和关闭哪些“切换”以不同方式处理数据的示例。 “ dataQualityPlots.py”具有允许您绘制单个采集并基于各种参数评估数据质量的功能。 如果要从Python笔记本运行这些功能,则“测试文件夹”中有一些功能可以测试LC M + N实验数据以及带有多个输入
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
OrbiDataPynbAnalysisCode-master.zip (34个子文件)
OrbiDataPynbAnalysisCode-master
DataAnalyzerWorker.py 4KB
DataAnalyzer.pyc 24KB
__pycache__
DataAnalyzer.cpython-37.pyc 21KB
DataAnalyzerWithPeakInteg.cpython-37.pyc 18KB
AnyRatioAnalysis_sz.ipynb 226KB
DataAnalyzer.py 32KB
dataQualityPlots.py 12KB
README.md 1KB
TestFolder
LC_M+N_Experiment_Multiple_Input_Files.ipynb 46KB
LCSingleFragmentTestFolder
20201214_07_5 uL Methionine 5uM M+1 5e4 133_2.xlsx 360KB
20201214_07_5 uL Methionine 5uM M+1 5e4 133_1.xlsx 360KB
20201214_07_5 uL Methionine 5uM M+1 5e4 133_3.xlsx 360KB
stats_output.csv 344B
all_data_output.csv 2KB
Single_Fragment_Example_20201214_07_5 uL Methionine 5uM M+1 5e4 133.xlsx 360KB
Multiple_Fragment_Example_20201217_06_Methionine M3 Frag 250 uM 2e5 NCE 60.xlsx 8.01MB
LC_M+N_Experiment_Single_Input_File.ipynb 1.02MB
GC_EI_Experiment_Multiple_Input_Files.ipynb 5KB
LCMultipleFragmentTestFolder
Multiple_Fragment_Example_20201217_06_Methionine M3 Frag 250 uM 2e5 NCE 60_01.xlsx 8.01MB
stats_output.csv 3KB
all_data_output.csv 35KB
Multiple_Fragment_Example_20201217_06_Methionine M3 Frag 250 uM 2e5 NCE 60_03.xlsx 8.01MB
Multiple_Fragment_Example_20201217_06_Methionine M3 Frag 250 uM 2e5 NCE 60_02.xlsx 8.01MB
GCTestFolder
Expected_all_data_output.csv 1KB
02172021_pxylene_newMethod_80_120_1ul_02.xlsx 1.51MB
stats_output.csv 531B
Expected_stats_output.csv 376B
all_data_output.csv 2KB
02172021_pxylene_newMethod_80_120_1ul_01.xlsx 1.5MB
02172021_pxylene_newMethod_80_120_1ul_03.xlsx 1.26MB
.gitattributes 66B
DataAnalyzerWithPeakInteg.py 37KB
.vscode
settings.json 56B
.ropeproject
config.py 5KB
共 34 条
- 1
资源评论
e起学美术
- 粉丝: 18
- 资源: 4631
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功