pediatric-genova:热那亚大学与加斯里尼儿童医院合作对新生儿脊髓MRI数据进行图像分析

小儿热那亚 热那亚大学与Gaslini儿童医院合作处理新生儿脊髓弥散MRI数据的图像分析管道。 图1显示了我们的图像处理管线的主要特征概述。由于SCT算法已在成人成像中得到验证，因此我们专门针对新生儿扫描定制了每个处理步骤，以便应用和改进dMRI模型（例如DKI）。 我们管道的主要步骤涉及运动校正，分割，椎骨标记，向PAM50地图集配准以及特定ROI中扩散度量的计算。 下图显示了我们的图像处理管道概述的关键功能的概述。 该管道将​​循环遍历位于data文件夹下的所有主题（或仅指定的主题），并且结果将串联到单个csv文件中，其中每一行将对应于一个主题。 文件将输出到data文件夹中。 将输出以下度量： dmri ：整个WM，GM和CST段中的所有DTI（FA，MD，AD，RD）和DKI（KFA，MK，AK，RK），在整个切片中平均 依存关系 该管道已在SCT v4.1.0上进行了测试