化石的不确定性
这些是创建(并希望重新创建)我的项目的必要文件,该项目以大脚形有袋动物为例,说明了下游宏观进化分析中的化石不确定性。
如果您下载了整个zip文件,则应该拥有所需的一切。 显然,您需要更改文件路径以使其与您的计算机匹配。
建模分析
所有分析都在“ Macropodoid_Modelling”文件(.pdf,.html,.Rmd)中进行了详细说明。 我以多种格式包含了它们,希望您可以根据自己的喜好使用它们。
树文件:
该项目的一部分是根据许多不同的约会计划估算树木。 它们在下面列出:
Tree_Span.trees :所有约会方法后验的树木样本,显示了估计的最大和最小年龄范围
Macropodinae_Fossil.trees :所有后验年代方法(与上述方法类似)中的树木样本,其中还包括缺少分子/形态数据的化石分类群。 在starBEAST分析中,这些分类单元受年龄/拓扑先
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