没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
genome_assembly:Amanita 项目脚本
共12个文件
py:11个
md:1个
需积分: 11 0 下载量 62 浏览量
2021-06-07
15:51:56
上传
评论
收藏 14KB ZIP 举报
温馨提示
基因组组装 此存储库包含我的一些脚本,这些脚本是我在密歇根州立大学基因组学、进化和开发实验室的实验室轮换期间编写的 惊人的双孢鹅膏菌基因组计划 是世界上毒性最强的真菌之一,因为它的环肽能抑制 RNA 聚合酶 II。 这种聚合酶的抑制会影响蛋白质合成,这可能是致命的。 组装和注释的基因组将对研究这种真菌有很大帮助。 这个基因组的组装有几个问题。 这种真菌是双核的,所以每个细胞都有两个细胞核。 目前尚不清楚基因组内容如何在这些细胞核之间分布。 这种真菌不能在实验室培养。 所以所有的组织都是在自然界收集的,这意味着测序材料在某种程度上受到了污染。 像大多数真菌一样,我们必须处理重复和重叠的编码区域。 我必须处理的另一个大问题是我自己。 我是一名本科生,受过训练的分子生物学家,从未在信息学或生物信息学领域工作过。 我可以访问两个基因组组装(Illumina 数据、 和 )和一个转录组组装
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
genome_assembly-master.zip (12个子文件)
genome_assembly-master
find_match_2.py 1KB
transcript_comparison.py 2KB
parse_NCBI.py 1KB
find_match_1.py 1KB
split_fasta.py 703B
parse_tab.py 839B
separate_strand_psl.py 828B
README.md 17KB
extract_annotation.py 608B
best_hit.py 1KB
extract.py 781B
assembly_stats.py 6KB
共 12 条
- 1
资源评论
活宝spring
- 粉丝: 28
- 资源: 4686
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功