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crick-osn-model-release:OSN模型的代码将公开发布
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2021-03-13
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嗅觉感觉神经元模型 该存储库包含用于生成数据并生成Ackels等人的图形X的代码。 (正在审核)。 生成多个肾小球的数据 通过运行python gen_osn_model_params.py --outputdir model-osn-data/gamp5 --glom_amp 5生成参数 通过cd model-osn-data/gamp5; python run_for_params.py params0.json为每个参数设置运行模型cd model-osn-data/gamp5; python run_for_params.py params0.json cd model-osn-data/gamp5; python run_for_params.py params0.json文件夹model-osn-data/gamp5现在为每个参数json文件包含一个文件夹,其中包含尖峰计数。
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crick-osn-model-release-main.zip (17个子文件)
crick-osn-model-release-main
.gitignore 44B
classify.all.sh 389B
README.md 3KB
gen_osn_model_params.py 4KB
run_for_params.py 3KB
single-glomerulus
make_figure.ipynb 230KB
osn_poster_zoom.pdf 180KB
osn_model.py 4KB
decoding-ppi-conc
response_integrals_per_conc.pdf 16KB
examine_decoding.ipynb 353KB
confusion_matrices.pdf 26KB
make_figures_decoding_ppi_conc.ipynb 132KB
classify.py 12KB
decoding-ppi
examine_decoding.ipynb 143KB
run_decoding_ppi.py 6KB
decoding_ppi_conc100.pdf 17KB
make_figure_decoding_ppi.ipynb 72KB
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