SuRankCo:从头开始的重叠群的监督排名-开源

SuRankCo是一款基于机器学习的软件，可对新一代测序数据的从头组装进行重叠群评分和排名。 它训练重叠群与已知参考基因组的比对，并预测尚无相关参照基因组的重叠群的得分和排名。 有关SuRankCo及其功能的更多详细信息，请参阅“ SuRankCo：从头开始的重叠群的监督排名” Mathias Kuhring，Piotr Wojtek Dabrowski，Andreas Nitsche和Bernhard Y. Renard（http://www.biomedcentral.com/1471- 2105/16/240 /摘要）请注意，建议在使用SuRankCo之前先阅读纸张和readme.txt文件。 2015年6月更新：*进行了较小的更改以启用BAM支持。 2014年2月更新：*除了支持ACE / FASTQ（QUAL）之外，还添加了对FASTA / SAM组件的支持。 注意：FASTA / SAM程序集的功能尚不包括BaseCount，BaseSeqmentCount和ContigQuality。