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deepTools:处理和分析深度测序数据的工具
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2021-05-13
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deepTools 用户友好的工具,用于探索深度测序数据 deepTools解决了处理现在从DNA测序中心常规生成的大量数据的挑战。 deepTools包含有用的模块,用于处理映射的读取数据以进行多次质量检查,以标准bedGraph和bigWig文件格式创建标准化的覆盖率文件,从而允许在不同文件之间进行比较(例如,处理和控制)。 最后,使用这种标准化和标准化的文件,deepTools可以创建许多可用于出版物的可视化文件,以识别基因组的富集和功能注释。 对于支持或问题,请发布到 。 对于错误报告和功能请求,请打开一个问题。 引文: RamírezF,Ryan DP,GrüningB,Bhardwaj V,Kilpert F,Richter AS,Heyne S,DündarF, 核酸研究。 2016年4月13日:gkw257。 说明文件: 我们的包含有关更多详细信息,以及 的 包括分
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deepTools:处理和分析深度测序数据的工具 (551个子文件)
sequence.2bit 3KB
phiX.2bit 1KB
sequence.2bit 300B
alignmentSieve 233B
test_paired2.bam.bai 2KB
test_paired.bam.bai 2KB
test_paired.bam.bai 2KB
paired.bam.bai 208B
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phiX.bam.bai 96B
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test_filtering.bam.bai 96B
test.bam.bai 96B
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paired.bam 500KB
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alignmentSieve2.bam 130KB
phiX.bam 57KB
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test_paired.bam 2KB
test_paired.bam 2KB
test_paired2.bam 2KB
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test_proper_pair_filtering.bam 314B
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bamCoverage 230B
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Whyte_TypicalEnhancers_ESC.bed 280KB
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bamCoverage_result4.bw 3KB
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bamCompare_result2.bw 620B
computeGCBias 232B
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computeMatrixOperations 242B
correctGCBias 232B
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test2.cram.crai 42B
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test_filtering2.cram.crai 42B
test1.cram.crai 42B
testB.cram.crai 41B
paired_chr2L.cram 250KB
test_filtering.cram 8KB
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