SPmirnaseq:工作流程模板

斯米纳什克 介绍 安装 if ( ! requireNamespace( " BiocManager " , quietly = TRUE )) { install.packages( " BiocManager " ) } BiocManager :: install( ' systemPipeR/SPmirnaseq ' ) 用法 管道摘要 阅读预处理 使用preprocessReads函数进行preprocessReads 用TrimGalore进行预处理！ Trimmomatic预处理 FASTQ质量报告 与参考基因组比对 针对miRBase成熟miRNA的比对 与miRBase发夹对齐 miRNA / isomiR注释 新型microRNA（miRDeep2，miRPara，sRNAbench）的预测