没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
MPRAdecoder:用于分析具有感兴趣区域的先验未知序列和相关条形码的原始MPRA数据的脚本
共47个文件
xlsx:15个
json:10个
pdf:7个
需积分: 9 0 下载量 118 浏览量
2021-03-20
08:26:02
上传
评论
收藏 45.21MB ZIP 举报
温馨提示
MPRA解码器 在俄罗斯新西伯利亚的IMCB SB RAS的细胞部实验室中用于分析原始MPRA数据的脚本。 该脚本的当前版本(1.0)由Alexey Pindyurin研究小组的Anna Letiagina,Evgeniya Omelina和Anton Ivankin设计。 依存关系要成功实现此脚本,您需要使用conda为python创建Spyder环境。 在Linux上安装conda: ://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/install/linux.html Spyder安装指南: : 激活spyder环境:conda激活spyder-env 您需要在spyder环境中拥有下一个软件包:Bio,scipy,pandas,matplotlib,seaborn,openpyxl。 要安装它们,请在命令行中输入:
资源详情
资源评论
资源推荐
收起资源包目录
MPRAdecoder-master.zip (47个子文件)
MPRAdecoder-master
readme.md 1KB
example
run_example_stat.txt 4KB
code
parameters.py 2KB
MPRAdecoder.py 170KB
readme.txt 2KB
input_data
E1.fastq.gz 4MB
M1.fastq.gz 1.75MB
N1.fastq.gz 4.07MB
M2.fastq.gz 2.17MB
E2.fastq.gz 4.04MB
reads.fastq.gz 20.37MB
N2.fastq.gz 3.69MB
output_data
37-44k_mers5.xlsx 9KB
37-44stats_k_mers4.xlsx 7KB
37-44k_mers6.xlsx 16KB
wt_log2.json 4KB
cont_dictionary.json 597B
37-44_ROIs.xlsx 30KB
37-44stats_k_mers5.xlsx 5KB
37-44normalizationN1, N2.xlsx 61KB
37-44k_mers4.xlsx 5KB
total_rep_dictionary.json 1.6MB
kdeplot_and_wt_37-44.pdf 7KB
log2_kdeplot_37-44.pdf 9KB
37-44.xlsx 91KB
BC_length_37-44.pdf 11KB
uniq_gold_dictionary.json 337KB
37-44stats_k_mers6.xlsx 5KB
ROI_with_different_barcodes_37-44.pdf 121KB
fastq_file_dictionary.json 42.23MB
mut_dictionary.json 53KB
37-44_control.xlsx 5KB
kdeplot_37-44.pdf 13KB
gold_dictionary.json 202KB
log2_kdeplot_and_wt_37-44.pdf 7KB
run_info.txt 3KB
mut_log2_dictionary.json 49KB
lib_diction.json 275B
37-44_mapping_M1, M2.xlsx 100KB
37-44expressionE1, E2.xlsx 62KB
37-44k_mers7.xlsx 14KB
rep_dictionary.json 3.61MB
barc_per_ROI_37-44.pdf 15KB
37-44_mapping.xlsx 100KB
37-44normalization.xlsx 61KB
run_example_without_demultiplexing.txt 8KB
run_example_with_demultiplexing.txt 8KB
共 47 条
- 1
Demeyi-邓子
- 粉丝: 22
- 资源: 4533
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 编程项目实战:基于ASP.NET架构的学生信息管理系统(含源代码+毕设文档)
- 毕设项目:学生信息管理系统(asp.net+源代码+文档)
- 腾讯研究院2024向AI而行共筑新质生产力-行业大模型调研报告
- 197a1ac6-f7cf-40a4-9ceb-422fa907ca05 (1).html
- java学习从入门到精通,全面了解面向对象开发
- 【抓取磁力链】DHTCrawler.zip
- 爱普生打印机废墨仓清零软件永久版和教程
- 数据库管理工具:dbeaver-ce-23.0.1-amd64.deb
- html贾程鑫10.zip
- 数据库管理工具:dbeaver-ce-24.1.0-x86-64-setup.exe
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
评论0