CD_mice_placenta

读我 此存储库包含“发育性昼夜节律紊乱改变小鼠胎盘信号”的数据和代码。 重要笔记： 原始测序数据（fastQ文件）和基因计数数据可在GEO中获得，登录号为GSE169266 样品号的ID号带有“ 10 ..”前缀。 例如，样本＃4 = ID号1004。 通过胎尾样品的qPCR测量所有胎盘样品的性别。 但是，在RNAseq分析中发现一个样本的性别标记错误。 样本＃9（“ 1009”）最初被标记为“男性”，但更改为“女性”。 同样，大坝的性别比从0.6更改为0.7，以反映性别的变化。 发现样品＃12（“ 1​​012”）是导致所有DESeq2结果的异常值，并且不包含在RNAseq分析中。 数据和代码 STAR基因组比对和基因计数代码可在“ STAR_code.txt”文件中找到。 图1：体重，胚胎和胎盘预后数据 “ Dam_weights.xlsx”文件和“ Data_embry