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SbmlInterface.jl:系统生物学标记语言和Julia之间的接口
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2021-02-24
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Sbml接口 SbmlInterface.jl是一个轻量级工具,可以将系统生物学标记语言(SBML)中指定的模型导入到Julia中。 更具体地说,SbmlInterface.jl使用Python libsbml库从SBML文件中提取常微分方程,初始条件和参数值。 尚不支持事件和约束以及其他几个SBML组件。 有几种方法可以在SBML和SbmlInterface中指定相同的模型。 如果在将SBML模型转换为Julia时遇到错误,请通过创建GitHub问题来帮助我们改善SbmlInterface.jl。 安装 SbmlInterface.jl在Julia软件包管理系统上尚不可用。 要安装SbmlInterface,请首先克隆此存储库: user@bash:/$ git clone https://github.com/paulflang/SbmlInterface.jl.git 由于Sbm
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SbmlInterface_jl-main.zip (18个子文件)
SbmlInterface.jl-main
.github
workflows
CompatHelper.yml 457B
ci.yml 3KB
TagBot.yml 362B
src
SbmlInterface.jl 448B
sbml2modelingtoolkit.jl 8KB
Project.toml 471B
LICENSE 1KB
test
runtests.jl 197B
fixtures
_model_v2.xml 7KB
_model_v1.xml 9KB
sbml2modelingtoolkit.jl 3KB
Manifest.toml 22KB
README.md 3KB
docs
src
index.md 119B
Project.toml 114B
Manifest.toml 23KB
make.jl 523B
.gitignore 60B
共 18 条
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