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microRNA-seq:小RNA分析
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2021-05-27
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微小RNA序列 小RNA或微RNA长约22 nt,主要通过抑制其靶mRNA的翻译来调节基因表达。 microRNA(miRs)与分化和癌症的许多细胞过程有关, 。 microRNA测序用于分析细胞中这些miR的组成,以及它们在健康和癌细胞等疾病之间的差异。 MicroRNA顺序命名。 如果microRNA具有以下名称/标识符: hsa-mir-121-1和hsa-mir-121-2:来自不同基因组位点的相同成熟miR has-miR-142-5p或hsa-miR-142-3p:5p =有义链,3p =反义链 测序可以单端进行,每个样品至少有200万个比对读数,重复两次或更多次。 参见 。 开始之前需要什么: gtf / gff文件,其中包含人类基因组中所有microRNA的坐标。 从下载。 从ensembl或UCSC下载的基因组DNA人类基因组参考(GRCh38 / hg38)
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