BriPy:用Python编写的BRIC-seq数据分析包。-开源

-什么是BRIC-seq？ BRIC-seq是5'-溴尿苷（BrU）免疫沉淀追迹-深度测序分析的缩写，是下一代测序（NGS）中确定每种转录本RNA稳定性的一种新方法。 它利用新合成的RNA的BrU进行代谢标记，以追踪BrU标记的RNA的时间顺序减少（脉冲追踪标记），然后用BrU抗体进行免疫沉淀，构建用于高通量测序和计算数据分析的cRNA文库。 -什么是BriPy？ BriPy软件包是用Python编写的BRIC-seq数据分析工具。 它可以计算每个转录本的RNA半衰期，并绘制描述RNA衰变动力学的图表。 将来，它将提供几个有用的模块（例如，从BAM文件或ELAND输出文件计算每个成绩单的RPKM）。 -先决条件要使用BriPy软件包，您将需要Python和以下扩展软件包。 Python2.7或更高版本的NumPy SciPy Matplotlib