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Perfect-Phylogeny-Constructor-and-Visualizer
共82个文件
class:16个
java:11个
css:10个
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2021-06-05
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自述文件 完美的系统发育构造器和可视化器 由尼克·戈尔茨创建。 项目是使用 Maven 构建的,用于存储依赖项。 运行:使用以下命令将 repo 的完整内容下载到文件 Build 中 $ mvn package 运行程序 ./run 这将启动服务器,要与之交互,请在浏览器中访问localhost:4567 所有系统发育都植根于首次进入的分类群(因此无根) 输入的矩阵值应使用空格分隔符和换行符为每个分类单元请不要以新行结束 1 0 0 1 对于二元完美系统发育,不需要状态树(只需确保正确的状态数)否则按如下方式输入状态树(每棵树之间的换行符) 美国广播公司 对于状态树中的每个连接 0-1 1-2 1-0 0-2 将是具有相应连接的两个状态树。 您还可以输入“default”,它将每个字符的状态树设置为线性图 0-1-2 ... -n 最后,“状态”设置最大状态。 使
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Perfect-Phylogeny-Constructor-and-Visualizer-master.zip (82个子文件)
Perfect-Phylogeny-Constructor-and-Visualizer-master
.project 541B
.mvn-classpath 2KB
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template
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ngoelz
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target
maven-status
maven-compiler-plugin
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default-testCompile
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inputFiles.lst 0B
compile
default-compile
createdFiles.lst 39B
inputFiles.lst 1KB
classes
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brown
cs
ngoelz
trees
PhylogenyMatrix.class 4KB
TaxaNode.class 4KB
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MultistatePerfectPhylogeny.class 9KB
Main.class 1KB
Main$RTree.class 1KB
BinaryPerfectPhylogeny.class 7KB
RandomTree.class 3KB
Main$1.class 212B
Edge.class 2KB
Taxa.class 621B
Main$GetHandler.class 1KB
Main$Calculate$1.class 819B
StateTreeNode.class 2KB
spark
template
freemarker
main.ftl 1KB
query.ftl 261B
results.ftl 2KB
static
js
main.js 5KB
d3.js 329KB
jquery-2.1.1.js 242KB
css
normalize.css 9KB
html5bp.css 6KB
main.css 480B
surefire-reports
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edu.brown.cs.ngoelz.StarsTest.txt 274B
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edu.brown.cs.ngoelz.KDTreeTest.txt 275B
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css
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site.css 53B
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maven-archiver
pom.properties 100B
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org.eclipse.core.resources.prefs 150B
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pom.xml 4KB
.classpath 1KB
.gitignore 354B
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zhangjames
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