sc-autoencoding:SimonStreib的学生实习，以减少单细胞数据资源-CSDN文库

共122个文件

py：70个

sh：41个

tsv：4个

需积分: 9 54 浏览量 2021-03-30 01:02:42 上传评论收藏 7.13MB ZIP 举报

资源推荐

资源详情

资源评论

收起资源包目录

package

sc-autoencoding:Simon Streib的学生实习，以减少单细胞数据（122个子文件）

preprocessing_overview.docx 16KB

dca_explained.docx 14KB

.gitignore 63B

README.md 3KB

1906.00722.pdf 6.3MB

sca_autoencoder_pre2_recopy.py 72KB

sca_autoencoder_2neck.py 71KB

sca_autoencoder.py 71KB

visualize.py 41KB

visualize_BACKUP.py 41KB

sca_autoencoder_pre_additional.py 36KB

network.py 33KB

visualize_nofold.py 24KB

bca_autoencoder_extraconstant.py 19KB

bca_autoencoder_large.py 19KB

bca_autoencoder_asymmetric.py 19KB

bca_autoencoder_larger.py 19KB

bca_autoencoder_noscaling.py 19KB

bca_autoencoder_inverted.py 19KB

bca_autoencoder.py 19KB

bca_autoencoder_default.py 19KB

bca_autoencoder_smaller.py 19KB

bca_autoencoder_default.py 19KB

bca_autoencoder_short.py 18KB

sca_PCA.py 16KB

sca_LSA.py 16KB

sca_kmcluster.py 14KB

sca_kmcluster_withTrainTest_DEPRECATED.py 14KB

sca_ICA.py 14KB

sca_randforest.py 13KB

sca_UMAP.py 13KB

sca_hierarchcluster.py 12KB

sca_dbscan.py 11KB

sca_classification_DEPRECATED.py 11KB

sca_countdata_preprocessor.py 10KB

sca_preprocessor.py 10KB

api.py 8KB

__main__.py 8KB

random_forrest_binary_parametersearch.py 8KB

data_inspector.py 8KB

sca_svm.py 7KB

random_forrest_multiclass_parametersearch.py 7KB

train.py 6KB

dbscan_gridsearch_pca.py 6KB

visualize_results_DEPRECATED.py 6KB

sca_datamerger.py 6KB

pca_toyscript.py 6KB

dbscan_gridsearch_visualizer.py 5KB

sca_tSNE.py 5KB

z_abandonned_sca_Isomap.py 5KB

loss.py 5KB

pca-kmcluster_evaluation.py 5KB

utils.py 5KB

io.py 4KB

hyper.py 4KB

dbscan_gridsearch.py 4KB

dbscan_epssearch_knn.py 3KB

layers.py 3KB

plot_dca_loss.py 2KB

test.py 2KB

countmatrix_maker_deprecated.py 2KB

scanpy_clustering3k.py 1KB

dca_denoised_to_matrix.py 1KB

assert_matrices_have_content.py 1002B

rp_barcodes_add_meaningless_column.py 922B

dca_output_to_matrix.py 731B

script_word.py 493B

script2.py 461B

script7.py 460B

script4.py 460B

script1.py 460B

script3.py 460B

script5.py 458B

script6.py 458B

__init__.py 53B

sca_preprocessing.R 7KB

sca_preprocessing.rmd 8KB

run_baselines.sh 12KB

do_evaluation.sh 10KB

replicate_zheng.sh 6KB

run_baselines.sh 5KB

run_all_complete_direkt.sh 5KB

run_SCA.sh 4KB

run_BCA.sh 4KB

analyse_all.sh 4KB

experiment_sca_11types.sh 3KB

run_DCA.sh 3KB

do_preprocessing.sh 3KB

experiment_bca_layerstructure.sh 3KB

optimizebl_tSNE_inpdim.sh 3KB

run_autoencoder_DCA.sh 3KB

optimizebl_ICA_inpdim.sh 3KB

optimizebl_UMAP_inpdim.sh 3KB

experiment_bca_noscaling.sh 3KB

experiment_bca_losses.sh 3KB

experiment_bca_optimizers.sh 2KB

run_autoencoder_BCA.sh 2KB

experiment_bca_activation.sh 2KB

optimizee_rand_forest.sh 2KB

run_autoencoder.sh 2KB

共 122 条

内容反馈

文清的男友

粉丝: 31
资源: 4654

最新资源

资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议，欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理！点击此处反馈

feedback-tip