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双歧杆菌 Bactopia是对细菌基因组进行完整分析的灵活途径。 Bactopia的目标是使用多种工具来处理您的数据,以便您可以更快地获得分析的乐趣! Bactopia可以分为三个主要部分: , 和。 Bactopia数据集提供了一个框架,用于将许多现有的公共数据集以及私有数据集纳入您的分析。Bactopia的下载,构建和(或)配置这些数据集的过程已实现自动化。 “ Bactopia分析管道”是Bactopia中主要的逐个隔离工作流。 使用输入FASTQ(本地或可从SRA / ENA获得)经过大量分析,包括:质量控制,组装,注释,参考映射,变体调用,minmer草图查询,blast对齐,插入位点预测,序列键入和更多的。 “ Bactopia分析管道”会根据可用的Bactopia数据集自动选择要包括的分析。 Bactopia Tools是一套用于比较分析的独立工作流程。 比较分析可能
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bactopia:灵活的管道,可对细菌基因组进行完整分析 (395个子文件)
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