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seqExtract:通过给出基因名称从参考基因组中提取序列
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2021-06-10
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序列提取 通过给出基因名称从参考基因组中提取序列 rescue.py 和 seq_extract_rescue.py 一起从宇宙文件中拯救缺失的基因。 seq_extract.py 只需要文件名作为输入。 ##seq_extract_rescue.py ####先决条件文件: GTF文件(基因转换格式) 人类参考基因 宇宙基因列表或基因名称列表 ####先决条件系统: pybedtools 皮萨姆 Python 2.7 ####用法: usage: seq_extract_rescue.py [-h] -g file -t gtf_file -r ref_genome [-o STR] [-p STR] [-b INT] [-f] [-c] Extract target genes and generate bloo
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seqExtract-master.zip (7个子文件)
seqExtract-master
hgnc_table.tsv 2.59MB
README.md 2KB
seq_extract_rescue.py 7KB
cancer_gene_census_1.txt 3KB
seq_extract.py 5KB
rescue.py 5KB
cancer_gene_census.csv 96KB
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刘怒威
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