GDAN_LIHC-CHOL_SNV_clustering:GDAN LIHC-CHOL SNV聚类

GDAN LIHC-CHOL SNV聚类 这是摘要文本相关部分的更新： 每个样品都分配了一个26基因的二元特征向量（0 =无突变； 1 =有突变）。 使用ConsensusClusterPlus（软件包版本1.40.0； R版本3.4.1），通过使用二进制距离度量（等效于Jaccard距离）在围绕仿体（PAM）的聚类算法进行分区的情况下，对1000个重复样本中的80％的样本进行了二次抽样，从而实现了无监督共识聚类。 ，生成4个群集。 以下是这些详细信息的清单： R版本3.4.1 ConsensusClusterPlus版本1.40.0 ConsensusClusterPlus（）选项： maxK = 10＃我们选择k = 4作为最佳聚类数 reps = 1000＃二次采样数 pItem = 0.8＃我们在每个子采样中选择了80％的采样 pFeature = 1.0＃每个子采样中包含